Por Alicia La planificación deportiva corrió a cargo, un año más, del presidente Anil Murthy y el director de fútbol Miguel Ángel Corona, en constante comunicación con el técnico. Anil Murthy se presentó con las manos vacías, solo pidiendo un poco más de cariño por parte de las instituciones y deseando que se prorrogue la ATE más allá del 15 de mayo previsto. Agrupación de Peñas Valencianistas, tras celebrar una asamblea extraordinaria, emitió un comunicado exigiendo la destitución del presidente Anil Murthy y un cambio en la gestión de Meriton Holdings al frente del club. Era un cambio deseado por muchos desde hacía meses, pero incomprensible a estas alturas de la temporada. El club cuenta desde la temporada 2008-09 con la popular mascota Koki. Libertad VCF incluso presentó un requerimiento notarial al club para que se suspendiera la junta por la vulneración del resto de accionistas, al no poder intervenir durante la celebración junta al ser telemática. El equipo deambuló por la mitad baja de la clasificación hasta el mes de diciembre, cuando estuvo a punto de tocar fondo en la primera eliminatoria de Copa al ser superado en juego por el Terrassa, equipo de la Tercera División, al ir perdiendo 2-0 hasta que en los minutos finales el equipo logró forzar la prórroga con dos goles y terminar ganando 2-4 gracias a la entrada al terreno de juego de futbolistas titulares como Carlos Soler, Yunus Musah y Gonçalo Guedes.
El 6 de marzo de 2009 el Estadio de la Independencia de la ciudad de Tunja recibió el aval positivo de la CONMEBOL para que Boyacá Chicó jugara sus partidos como local de la fase de grupos de la Copa Libertadores 2009 gracias a la ampliación de la capacidad del estadio a 20.630 espectadores con tribunas metálicas. La salvación matemática llegó en la jornada 36ª gracias a la derrota del Real Valladolid ante el Villarreal CF. Con el equipo ya salvado, el público volvió a las gradas de Mestalla el 16 de mayo de 2021 ante el Éibar con unos 2600 aficionados que no dudaron en su gran mayoría en protestar contra el máximo accionista durante todo el encuentro. La tranquilidad respecto a un posible descenso de categoría llegó con la victoria 3-0 ante el Real Valladolid en el nuevo debut de Voro, tomando las riendas del equipo por séptima vez en su carrera. ↑ «Las cinco razones del descenso de Boyacá Chicó, según Eduardo Pimentel». Seis jornadas consecutivas sin ganar condujeron al club a tomar la sorprendente decisión de destituir al técnico Javi Gracia, decisión totalmente inesperada al faltar solo 4 jornadas para finalizar la temporada, sin la permanencia asegurada pero con 6 puntos de ventaja sobre el descenso.
Sevilla en Copa hizo a la afición estallar contra la directiva y contra el técnico por alinear un once titular muy poco competitivo. Poco después presentaba su dimisión uno de los pocos miembros españoles del consejo de administración, el valenciano Dr. José Luis Zaragosí, al no haber podido alcanzar su objetivo de mediar para conseguir la ansiada paz social entre el valencianismo y el máximo accionista. A mediados de marzo la plataforma opositora De Torino a Mestalla empezó a perder apoyos por discrepancias entre sus miembros. En un principio no había ningún problema con Juan Martín Queralt, presidente de la plataforma, pero sí con la directiva de la Agrupación de Peñas Valencianistas, nueva camiseta psg con Fede Sagreras como presidente y además vicepresidente de la plataforma opositora. Exfutbolistas como Roberto Fabián Ayala, Santiago Cañizares, Javier Subirats, Mario Alberto Kempes, el actor valenciano Enrique Arce y el exciclista Ángel Casero mostraron su apoyo a través de una nueva plataforma de protesta. La organización corrió a cargo de los colectivos Libertad VCF y Curva Nord, pero se sumaron muchos más, además de algunos exfutbolistas del club.
Murthy negoció con Míchel González para hacerse cargo del club lo que quedaba de temporada. 3 millones de euros si abandonaba unilateralmente su cargo. A partir de ese momento el club pudo hacerse con los servicios de Marcos André por 8,5 millones de euros, Foulquier por 2,5 millones de euros y las cesiones de Hugo Duro y Hélder Costa, ambas con opción de compra no obligatoria. El mercado de fichajes fue muy complejo, sobre todo por la falta de liquidez económica, y solo se alcanzaron las cesiones del central paraguayo Omar Alderete (con opción de compra no obligatoria) y la llegada del joven guardameta Mamardashvili para el filial, aunque su gran rendimiento le llevó al primer equipo. Los motivos de las quejas se pueden resumir en casi la totalidad de decisiones que tomó Meriton desde su compra de la mayoría accionarial en 2014, pero los traspasos casi regalados de Coquelin y Parejo al Villarreal fueron la gota que colmó el vaso porque fueron traspasos motivados más por motivos personales que por motivos profesionales. Antifaces. Los jugadores B1 deben utilizar obligatoriamente un sistema de antifaces y parches oculares, que tienen la función de impedir que aquellos que pueden percibir luminosidades, utilicen esa capacidad para obtener ventajas deportivas.